Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAMP4Q969E2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms