Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms