Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms