Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms