Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms