Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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