Protein–RNA interactions for Protein: Q86V20

FAM35A, Protein FAM35A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35AQ86V20 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM35AQ86V20 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms