Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms