Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms