Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms