Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SAMD13Q5VXD3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms