Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms