Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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