Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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