Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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