Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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