Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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