Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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