Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms