Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms