Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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