Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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