Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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