Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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IRF5Q13568 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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