Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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