Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms