Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms