Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CDH17Q12864 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CDH17Q12864 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CDH17Q12864 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CDH17Q12864 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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