Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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