Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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