Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms