Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms