Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms