Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms