Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms