Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P61574 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms