Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBASH3AP57075 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms