Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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