Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HADHBP55084 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms