Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPAP53621 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms