Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms