Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms