Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms