Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPD1P17405 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms