Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCFC2P16383 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms