Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms