Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL8P10145 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms