Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms