Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPBP07199 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPBP07199 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPBP07199 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPBP07199 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms