Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F9P00740 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F9P00740 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F9P00740 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms